生態(tài)農(nóng)業(yè)規(guī)劃是以生態(tài)學(xué)、經(jīng)濟(jì)學(xué)和系統(tǒng)工程理論為指導(dǎo)，以經(jīng)濟(jì)建設(shè)為中心，以社會(huì)調(diào)控為保障，以政策為引導(dǎo)，科技驅(qū)動(dòng)，應(yīng)用生態(tài)系統(tǒng)的原理和系統(tǒng)科學(xué)的方法，通過合理利用自然資源和人工模擬本地區(qū)的頂級(jí)生態(tài)系統(tǒng)，選擇多種在生態(tài)上和經(jīng)濟(jì)上都有優(yōu)勢的生物，采用一套套生態(tài)農(nóng)藝流程，按食物鏈關(guān)系和其他生態(tài)關(guān)系將這些物種的裁培、飼養(yǎng)和養(yǎng)殖組成一條條生產(chǎn)線，并將這些生產(chǎn)線在時(shí)間上和空間上多層次地配置到農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)中去，使之既獲得持續(xù)大（或優(yōu)）的生產(chǎn)力和經(jīng)濟(jì)效益，又獲得一個(gè)良好的、協(xié)調(diào)的生態(tài)系統(tǒng)。
　　規(guī)劃必須把長遠(yuǎn)利益與近期設(shè)想統(tǒng)一起來，把種植業(yè)、養(yǎng)殖業(yè)、工商業(yè)和農(nóng)田、村鎮(zhèn)、能源等多項(xiàng)建設(shè)密切結(jié)合起來，把發(fā)展農(nóng)村經(jīng)濟(jì)同保護(hù)生態(tài)環(huán)境結(jié)合起來，因此，進(jìn)行生態(tài)農(nóng)業(yè)規(guī)劃應(yīng)遵循以下基本原則：
　　1、整體性原則。農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)是受人工控制的自然、經(jīng)濟(jì)、社會(huì)的復(fù)合系統(tǒng)，制定規(guī)劃時(shí)要以生態(tài)學(xué)原理和經(jīng)濟(jì)規(guī)律為指導(dǎo)，用系統(tǒng)、整體觀念，進(jìn)行全面規(guī)劃，做好總體布局。合理安排，統(tǒng)籌兼顧，協(xié)調(diào)農(nóng)業(yè)內(nèi)外各部門之間的關(guān)系，發(fā)揮系統(tǒng)的整體功能，實(shí)現(xiàn)生態(tài)、經(jīng)濟(jì)、社會(huì)三大效益的同步增長。
　　2、資源開發(fā)、利用和保護(hù)相結(jié)合原則。對資源不僅要合理利用，還要積極的保護(hù)，對可更新資源合理利用與增殖，對不可更新資源合理利用與保護(hù)，只有這樣，方不致于對資源的開發(fā)利用消耗超過資源再生速度，使資源得到永續(xù)利用。
　　3、因地制宜的原則。農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)的生態(tài)環(huán)境具有多樣性和地域差異性，各地區(qū)的農(nóng)業(yè)生態(tài)工程設(shè)計(jì)和配套技術(shù)，生態(tài)農(nóng)業(yè)的建設(shè)不可能是相同的，必須根據(jù)當(dāng)?shù)鼐唧w生態(tài)環(huán)境特點(diǎn)、自然條件和社會(huì)經(jīng)濟(jì)條件，選擇農(nóng)民群眾關(guān)心、見效快的項(xiàng)目。揚(yáng)長避短，發(fā)揮地區(qū)優(yōu)勢，制定規(guī)劃，發(fā)展適合當(dāng)?shù)靥攸c(diǎn)的類型和模式。
　　4、物質(zhì)循環(huán)、多級(jí)利用的原則。根據(jù)生態(tài)學(xué)原理合理設(shè)計(jì)食物鏈，利用農(nóng)業(yè)有機(jī)物質(zhì)，包括“廢棄物”（指死體、殘?bào)w、排泄物）等實(shí)行多次利用、多級(jí)得益、循環(huán)利用和深加工等。
　　5、擴(kuò)大綠色植被原則。綠色植物是轉(zhuǎn)化太陽能，實(shí)現(xiàn)性生產(chǎn)的重要機(jī)器，是保護(hù)生態(tài)環(huán)境重要的措施，應(yīng)充分考慮將一切土地和部分水面綠化起來。
　　6、多業(yè)結(jié)合、集約經(jīng)營原則。生態(tài)農(nóng)業(yè)必須是多業(yè)結(jié)合，包括農(nóng)業(yè)內(nèi)部的橫向聯(lián)系和農(nóng)業(yè)外部的橫向聯(lián)系，實(shí)行集約經(jīng)營，揚(yáng)長避短，發(fā)揮優(yōu)勢。
　　7、實(shí)現(xiàn)“三大效益”原則。生態(tài)農(nóng)業(yè)建設(shè)措施必須達(dá)到生態(tài)上適宜，技術(shù)上可行，經(jīng)濟(jì)上合理，有明顯的生態(tài)、經(jīng)濟(jì)和社會(huì)效益。